32 anos se passaram desde a derrota inicial dos Invasores. A A.E.G.I.S está praticamente desmantelada agora e se tornou uma organização subterrânea que consiste em apenas alguns Guardiões do Portal restantes para salvar a humanidade. Uma das integrantes, Ayane Isuzu, está cansada da sociedade como um todo, embora continue a derrotar os Invasores por despeito ao pai. De repente, ela descobre o renascimento do General das Máquinas (Kikai Shogun) e do Conde Demônio (Akuma Hakushaku), mas uma misteriosa garota fantasma agora os acompanha. Cabe a Ayane e aos remanescentes da A.E.G.I.S detê-los e salvar a humanidade mais uma vez. (Fonte: Anime News Network)
Tradução automática do original em inglês.